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要了解為什麼會出現月經紊亂，首先要從正常的月經周期來開始說起。
女性的月經是女性性成熟的一個標志，每個月，子宮都在為懷孕做著提前的準備工作。子宮內膜有一個功能層，每個月在卵巢的雌激素的影響下開始生長，到了月經中期長到一定的厚度，為可能的受精卵做好了在子宮上的種植做準備，在此後月經的後半期，進入所謂的黃體期，卵巢分泌孕激素，支持可能的受精卵的發育，如果沒有胚胎在子宮內的種植，那么準備好的子宮內膜就開始脫落，形成月經。
子宮內膜的周期性改變，如上所述，是受卵巢分泌的激素的調節的，卵巢在排卵前，以分泌雌激素為主，雌激素支持著子宮內膜的生長，在排卵後，形成一個黃體，黃體分泌孕激素。孕激素在月經的後半期會升高身體的體溫，即在圖中看到的紅線。
卵巢的激素的周期性改變則是受上一級的中樞調控的，這個“上級”是腦子里面的垂體，它周期性分泌FSH（促卵泡生成素）和LH（促黃體生成素）。
而同樣，垂體是受上級來管理的，它的上級是下丘腦，下丘腦則是大腦中樞，思維、精神因素都可能成為影響下丘腦的因素。
了解了這個下丘腦——垂體——卵巢——子宮內膜這一個垂直的軸，就可以知道正常的月經是怎麼來的，也就可以理解在月經紊亂的時候可能是發生了什麼問題。
通常情況下，進入青春期後，需要一段時間來建立月經的規律性，這是正常現象，一般情況下初潮後2-3年即可建立其規律性。
懷孕了的時候，受精卵種植在子宮內膜上，開始的時候需要卵巢的黃體的孕激素的支持，到了絨毛生長後，就由絨毛分泌的hCG（絨毛促性腺激素）來支撐黃體的生長和分泌孕激素，這時候月經就不會來。子宮將會繼續為胎兒的發育支持下去。
若沒有懷孕的情況，月經推遲，其它更為常見的是外界環境，譬如天氣、精神、情緒、飲食、肥胖、藥物以及身體里面其它疾病造成對下丘腦垂體卵巢功能軸的影響，這樣的影響一般都是暫時的，在去除了外因或者影響月經的疾病得到治療了以後，通常月經就可以恢復其規律性，不必太緊張。如果超過3個月不來月經，方考慮用藥物進行撤退治療。
這個軸的規律性如果長期得不到建立，就會表現為月經的紊亂，或者是月經周期長，或者是月經一來好多天，這樣的情況也是病態的情況。長期如此，也存在著身體過度受雌激素的刺激的影響，有可能會增加子宮內膜癌癥的風險。所以若是有長期的紊亂，需要進行藥物的調整。對于年輕生育期的女性，重在調整月經的規律性，若有生育要求，可能會使用藥物來進行促排卵。
（若有身體不適，廖露）